根据专业的分类，MIT被分成了如下6个学院：
1、建筑及城市规划学院（School of Architecture and Planning）：建筑学、媒体艺术与科学、都市研究与计划
2、工程学院（School of Engineering）：航空太空工程、生物医学工程、化学工程、土木工程、环境工程、电机工程、计算机科学与工程、资讯科学、核子工程、机械工程、材料科学与工程
3、人文及社会科学学院（School of Humanities,Arts,and Social Sciences）：人类学、比较媒体研究、经济学、文学、历史学、语言学、哲学、音乐与戏剧艺术、政治学、女性研究、写作计划组
4、阿尔佛雷德·P·斯隆管理学院（Alfred P. Sloan School of Management）：管理学
5、理学院（School of Science）：数学、物理学、化学、生物学、脑与认知科学、地球科学（包括大气科学和行星科学）
6、维泰克健康科学技术学院(Whitaker College of Health Sciences and Technology)
研究生院共有六所：建筑及城市规划研究生院、工科研究生院、人文社会学研究生院、斯隆管理研究生院、自然科学研究生院、健康科学研究生院。
学校可授予的学位包括：理学学士（Bachelor of Science）、城市规划硕士（Master in City Planning）、建筑学硕士（Master of Architecture）、理学硕士(Master of Science）、工程硕士（Master of Engineering）、哲学博士(Doctor of Philosophy）、电子工程博士（Electrical Engineer）、理学博士（Doctor of Science）等。
由于对工程、科学和艺术的侧重，麻省理工学院既没有法学院，也没有神学院。自1970年起，与哈佛系学院合作创建了哈佛-麻省理工卫生科学与技术部（Harvard-MIT Division of Health Sciences and Technology)，专门培养生物医学方面的特殊人才。
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重点学科：
该大学的工程系是最知名、最多人申请入读和最“难读”的学系，并曾一连七届获得美国工科研究生课程冠军，其中以电子工程专业名气最响，紧跟其后的是机械工程。其余的学科如物理学、化学、经济学、哲学、政治学也都获得好评。
